PHPXRef ist ein Hilfsprogramm, das es erleichtern soll den Überblick über umfangreiche PHP Projekte zu behalten. Zu diesem Zweck kann es ein Projektverzeichnis einlesen und statische HTML Seiten aus dem Quellcode und der darin enthaltenen Dokumentation erzeugen.

PHPXRef verarbeitet Dokumentation, die im Format von phpdoc innerhalb des Quellcodes angelegt wurde. Außerdem indiziert PHPXref Klassen, Funktionen, Variablen, Konstanten und über require bzw. include eingebundene Dateien und kann so Querverweise zwischen den einzelnen Quelltexten herstellen.

So ist es beispielsweise auf einfachste Weise möglich festzustellen, in welchen Dateien eine bestimmte Funktion, Variable etc. Verwendung findet und aufgerufen wird, bzw. wo diese definiert wurde. PHPXRef bietet umfangreiche Suchmöglichkeiten innerhalb der Quelltexte und stellt diese formatiert und coloriert dar.